L'intero impianto della biblioteca è destinato all'archivio e all'informatizzazione della biblioteca principale del Giappone. Gli spazi, pertanto, sono organizzati per permettere un fluido percorso degli oggetti (libri) e delle persone. Il secondo piano interrato è destinato alla distribuzione organizzata dagli "stacks", il primo seminterrato comprende, oltre a degli stacks, il dipartimento di sistemi operativi e servizi e consegna documenti.